MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 plasmid pJ7-1

Total Repeats: 2228

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018225	CGG	2	6	20	25	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018225	TCG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
3	NC_018225	ACC	2	6	189	194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
4	NC_018225	GAC	2	6	229	234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
5	NC_018225	TTC	2	6	244	249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771727
6	NC_018225	CGTCGA	2	12	327	338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771727
7	NC_018225	TCG	2	6	386	391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
8	NC_018225	GGC	2	6	407	412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
9	NC_018225	TCG	2	6	449	454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
10	NC_018225	CGT	2	6	495	500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
11	NC_018225	CGG	2	6	504	509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
12	NC_018225	ATC	2	6	533	538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
13	NC_018225	GCC	2	6	573	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
14	NC_018225	GAC	2	6	592	597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
15	NC_018225	CGA	2	6	607	612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
16	NC_018225	CGA	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
17	NC_018225	CGC	2	6	680	685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
18	NC_018225	GGT	2	6	695	700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
19	NC_018225	AACG	2	8	762	769	50 %	0 %	25 %	25 %	397771727
20	NC_018225	CGTC	2	8	779	786	0 %	25 %	25 %	50 %	397771727
21	NC_018225	GTC	2	6	859	864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
22	NC_018225	GCG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
23	NC_018225	TCG	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
24	NC_018225	TTC	2	6	937	942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771727
25	NC_018225	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
26	NC_018225	TCG	2	6	950	955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
27	NC_018225	GAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
28	NC_018225	GAC	2	6	994	999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
29	NC_018225	GAA	2	6	1047	1052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
30	NC_018225	CGA	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
31	NC_018225	ACG	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
32	NC_018225	CTC	2	6	1141	1146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
33	NC_018225	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771727
34	NC_018225	CCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
35	NC_018225	GAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
36	NC_018225	TCGTCC	2	12	1340	1351	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397771727
37	NC_018225	CAG	2	6	1402	1407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
38	NC_018225	CAG	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
39	NC_018225	CGA	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
40	NC_018225	CCG	2	6	1525	1530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
41	NC_018225	TGG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
42	NC_018225	CAT	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
43	NC_018225	ACG	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
44	NC_018225	CT	3	6	1604	1609	0 %	50 %	0 %	50 %	397771727
45	NC_018225	TGG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771727
46	NC_018225	CGT	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
47	NC_018225	TCG	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
48	NC_018225	TG	3	6	1667	1672	0 %	50 %	50 %	0 %	397771727
49	NC_018225	CTAC	2	8	1677	1684	25 %	25 %	0 %	50 %	397771727
50	NC_018225	CGA	2	6	1713	1718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
51	NC_018225	CCTTCT	2	12	1754	1765	0 %	50 %	0 %	50 %	397771727
52	NC_018225	GGA	2	6	1803	1808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
53	NC_018225	TCC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
54	NC_018225	GAT	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
55	NC_018225	TCG	2	6	1886	1891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
56	NC_018225	CGA	2	6	1929	1934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
57	NC_018225	GAC	2	6	1963	1968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
58	NC_018225	CGC	3	9	1974	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
59	NC_018225	ACC	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
60	NC_018225	CGG	2	6	2146	2151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
61	NC_018225	ACG	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
62	NC_018225	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
63	NC_018225	AGCG	2	8	2279	2286	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
64	NC_018225	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771727
65	NC_018225	CGACG	2	10	2335	2344	20 %	0 %	40 %	40 %	397771727
66	NC_018225	TCA	2	6	2375	2380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
67	NC_018225	GAG	2	6	2383	2388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
68	NC_018225	CGA	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
69	NC_018225	AGC	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
70	NC_018225	CGGAAC	2	12	2494	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
71	NC_018225	ACG	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
72	NC_018225	AAC	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
73	NC_018225	TCGA	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	397771727
74	NC_018225	CCGA	2	8	2611	2618	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
75	NC_018225	GCG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771727
76	NC_018225	GA	3	6	2687	2692	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
77	NC_018225	GCC	3	9	2697	2705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
78	NC_018225	GGA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
79	NC_018225	CTGG	2	8	2879	2886	0 %	25 %	50 %	25 %	397771727
80	NC_018225	GTA	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
81	NC_018225	CGACA	2	10	2901	2910	40 %	0 %	20 %	40 %	397771727
82	NC_018225	CGAC	2	8	2936	2943	25 %	0 %	25 %	50 %	397771727
83	NC_018225	TCA	2	6	2960	2965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
84	NC_018225	CGA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
85	NC_018225	GACG	2	8	3075	3082	25 %	0 %	50 %	25 %	397771727
86	NC_018225	CGA	2	6	3192	3197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
87	NC_018225	TGA	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771727
88	NC_018225	CCT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
89	NC_018225	GAG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
90	NC_018225	TAC	2	6	3361	3366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
91	NC_018225	GA	3	6	3437	3442	50 %	0 %	50 %	0 %	397771727
92	NC_018225	CGC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771727
93	NC_018225	CCT	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771727
94	NC_018225	CAG	3	9	3487	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
95	NC_018225	TAC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771727
96	NC_018225	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
97	NC_018225	CGA	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
98	NC_018225	CAA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771727
99	NC_018225	CGGAT	2	10	3731	3740	20 %	20 %	40 %	20 %	397771727
100	NC_018225	GAG	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
101	NC_018225	CGA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
102	NC_018225	CAG	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771727
103	NC_018225	ACC	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771727
104	NC_018225	AGG	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771727
105	NC_018225	GAG	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771728
106	NC_018225	CTA	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
107	NC_018225	TCA	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
108	NC_018225	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771728
109	NC_018225	CGG	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771728
110	NC_018225	CAGA	2	8	4059	4066	50 %	0 %	25 %	25 %	397771728
111	NC_018225	TAC	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771728
112	NC_018225	CGA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
113	NC_018225	GAC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
114	NC_018225	CTC	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
115	NC_018225	CGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771728
116	NC_018225	GCT	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771728
117	NC_018225	GAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771728
118	NC_018225	CCT	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
119	NC_018225	ACG	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
120	NC_018225	CCT	3	9	4580	4588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771728
121	NC_018225	CGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771728
122	NC_018225	CCG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771728
123	NC_018225	CGCC	2	8	4643	4650	0 %	0 %	25 %	75 %	397771728
124	NC_018225	TCGG	2	8	4718	4725	0 %	25 %	50 %	25 %	397771728
125	NC_018225	CGA	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771728
126	NC_018225	CGA	3	9	4768	4776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771729
127	NC_018225	CGT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771729
128	NC_018225	CGG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771729
129	NC_018225	GAG	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771729
130	NC_018225	TCG	2	6	4971	4976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771729
131	NC_018225	TG	3	6	5021	5026	0 %	50 %	50 %	0 %	397771729
132	NC_018225	CAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771729
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402	NC_018225	CGA	2	6	16219	16224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771738
403	NC_018225	TCG	2	6	16249	16254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771738
404	NC_018225	GCG	2	6	16288	16293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771738
405	NC_018225	CCT	2	6	16304	16309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771738
406	NC_018225	GCCG	2	8	16328	16335	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
407	NC_018225	CGA	2	6	16364	16369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771738
408	NC_018225	GC	3	6	16377	16382	0 %	0 %	50 %	50 %	397771738
409	NC_018225	GTC	2	6	16427	16432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771738
410	NC_018225	AGG	2	6	16435	16440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771738
411	NC_018225	GCC	2	6	16458	16463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771738
412	NC_018225	CGCGT	2	10	16559	16568	0 %	20 %	40 %	40 %	397771738
413	NC_018225	CGA	2	6	16583	16588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771738
414	NC_018225	CGA	2	6	16592	16597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771738
415	NC_018225	GTC	2	6	16667	16672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771738
416	NC_018225	CGA	2	6	16678	16683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771738
417	NC_018225	CGAC	2	8	16717	16724	25 %	0 %	25 %	50 %	397771738
418	NC_018225	GT	3	6	16794	16799	0 %	50 %	50 %	0 %	397771738
419	NC_018225	GGCTC	2	10	16800	16809	0 %	20 %	40 %	40 %	397771738
420	NC_018225	GAC	2	6	17049	17054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771739
421	NC_018225	GA	4	8	17062	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
422	NC_018225	GA	3	6	17081	17086	50 %	0 %	50 %	0 %	397771739
423	NC_018225	CCT	2	6	17087	17092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771739
424	NC_018225	CGA	2	6	17123	17128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771739
425	NC_018225	AGG	2	6	17182	17187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
426	NC_018225	CGA	2	6	17270	17275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771740
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428	NC_018225	ACC	2	6	17486	17491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771740
429	NC_018225	CGA	2	6	17499	17504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771740
430	NC_018225	CGG	2	6	17522	17527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771740
431	NC_018225	CGT	2	6	17568	17573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771740
432	NC_018225	TCC	2	6	17585	17590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771740
433	NC_018225	CGA	2	6	17619	17624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771740
434	NC_018225	GTT	2	6	17630	17635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018225	CGA	2	6	17821	17826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
436	NC_018225	GCT	2	6	17851	17856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771741
437	NC_018225	CGA	2	6	17908	17913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
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439	NC_018225	CGA	2	6	17968	17973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
440	NC_018225	TCG	2	6	17976	17981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771741
441	NC_018225	CCA	2	6	18001	18006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771741
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444	NC_018225	CGA	2	6	18027	18032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771741
445	NC_018225	GC	3	6	18120	18125	0 %	0 %	50 %	50 %	397771741
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452	NC_018225	CTC	2	6	18385	18390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_018225	AAT	2	6	18405	18410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_018225	GGT	2	6	18433	18438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
455	NC_018225	TGAC	2	8	18439	18446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
456	NC_018225	CTC	2	6	18508	18513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771742
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458	NC_018225	CAA	2	6	18531	18536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771742
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460	NC_018225	TTTCG	2	10	18720	18729	0 %	60 %	20 %	20 %	397771742
461	NC_018225	GCC	2	6	18762	18767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
462	NC_018225	GCTC	2	8	18810	18817	0 %	25 %	25 %	50 %	397771742
463	NC_018225	CCA	2	6	18828	18833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771742
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466	NC_018225	CTC	2	6	18985	18990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771742
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471	NC_018225	CT	4	8	19408	19415	0 %	50 %	0 %	50 %	397771742
472	NC_018225	ATCGG	2	10	19565	19574	20 %	20 %	40 %	20 %	397771742
473	NC_018225	CCG	2	6	19638	19643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771742
474	NC_018225	AG	3	6	19697	19702	50 %	0 %	50 %	0 %	397771742
475	NC_018225	CGA	2	6	19704	19709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
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477	NC_018225	GCT	2	6	19759	19764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771742
478	NC_018225	TGC	2	6	19798	19803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771742
479	NC_018225	TCG	2	6	19853	19858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771742
480	NC_018225	ATC	2	6	19895	19900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771742
481	NC_018225	TCA	2	6	20033	20038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771742
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485	NC_018225	ATA	2	6	20176	20181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397771742
486	NC_018225	CGA	2	6	20285	20290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
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488	NC_018225	G	6	6	20441	20446	0 %	0 %	100 %	0 %	397771742
489	NC_018225	GCCAGA	2	12	20490	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
490	NC_018225	AGGT	2	8	20540	20547	25 %	25 %	50 %	0 %	397771742
491	NC_018225	GTT	2	6	20566	20571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771742
492	NC_018225	CAC	2	6	20618	20623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771742
493	NC_018225	CAG	2	6	20641	20646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771742
494	NC_018225	AGT	2	6	20678	20683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771742
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497	NC_018225	GAA	2	6	20950	20955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771742
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500	NC_018225	CGG	2	6	21004	21009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771742

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